经济学原理

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继人类基因组计划之后,全球顶尖生物学家推出了一项名为地球生物基因组计划(EBP)的宏伟设想,目标是从地球上所有复杂生物的标本中收集DNA序列。不过要想完整收集全部万种真核生物的标本是个巨大的难题,因此,一个全新的亚马逊开放式生物数据项目可能成为重要的合作方。

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距离人类基因组序列图完成已有15年,在此期间,其他一些生物体的基因组已被破译,但这些多数为一次性项目,更大规模的研究进展缓慢。年底,23位生物学权威齐聚华盛顿特区的史密森学会(SmithsonianInstitution),制定了一项宏伟计划——专家们宣称,是时候开展一个规模和范围堪比人类基因组计划的大项目了:目标是从地球上所有复杂生物的标本中收集DNA序列,命名为地球生物基因组计划(EBP)。EBP明确表述的目标是在十年内对全部万种已知真核生物的基因组测序。真核生物是细胞中具有完整细胞核的生物体。计划分三个阶段,先是用三年时间在每个真核生物科中选一个代表物种进行详细的DNA测序。真核生物共有约个科、大概15万个属。接着再花三年对每一个属中的一个物种进行较粗略的测序。最后四年,计划将完成对剩余物种更粗略的测序。这是一个雄心勃勃的时间表。不过计划真正困难的部分是收集所需的标本。约有50万个物种可以取自植物园、动物园或史密森学会这样的机构,但其余的必须从野外收集。自主无人机等尖端科技和通过民间收集样本这样技术含量不高的方法都可以加以运用。不过,这样的工作可能需要几十年才能完成。中国的华大基因、美国洛克菲勒大学的基因组资源中心(GenomicResourceCentre)和英国的桑格研究所(SangerInstitute)等大型测序中心以及一些较小的测序机构都渴望从中分一杯羹。对于项目后期的粗略测序,华大基因收购的加州创业公司完整基因组(CompleteGenomics)认为它可以将成本降低到美元。英国公司牛津纳米孔(OxfordNanopore)制造的手持式测序仪也可能把成本控制在同等水平,而且还具备便携的优点。计划也可能因《名古屋议定书》而举步维艰,这个国际协定规定在各国境内取样必须获得该国政府许可,许多测序项目正是这一环节碰壁。因此,EBP的发起者非常想与一个名叫亚马逊代码库(AmazonBankofCodes)的开放式民间数据计划展开合作。

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